乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是全球性重大公共卫生健康问题之一，目前，全球乙肝病毒慢性感染者人数较多。HBV属嗜肝DNA病毒科，在人体肝脏细胞核内可形成cccDNA、整合入人体基因组等病毒DNA形式稳定存在，这是HBV维持长期慢性感染的关键。因此，研究乙肝病毒与宿主基因组相互作用特征具有重要意义。
近期，中国科学院生物物理研究所研究员杨鹏远课题组与北京大学 学院研究员季雄课题组合作，在Cell Discovery上，发表了题为3D landscape of Hepatitis B virus interactions with human chromatins的研究论文。该研究阐述了乙肝病毒cccDNA和整合形式的HBV DNA与宿主基因组相互作用的特征，为HBV感染及相关疾病治疗提供了新的潜在靶点。
该研究采用3C-HTGTS（3C-high-throughput genome-wide sequencing）技术，研究人员在HBV感染HepG2-NTCP细胞中发现，HBV cccDNA与宿主基因组的相互作用倾向于富含H3K4me3、H3K9ac、H3K4me1和H3K27ac等组蛋白修饰的活跃增强子（Enhancer）及启动子（Promoter）。在稳定表达HBV的HepAD38细胞中发现，整合形式的HBV DNA能够与宿主基因组DNA形成染色质环（chromatin loop）结构，且倾向于和宿主基因的启动区域互作。
研究发现，HBV cccDNA与宿主基因组中富含H3K4me1区域相互作用，进而通过染色质免疫共沉淀（ChIP-qPCR），研究人员发现，HBV cccDNA上存在丰富的组蛋白H3K4me1修饰。当敲低细胞内的介导组蛋白H3K4me1发生的赖氨酸特异性甲基转移酶2C/D（KMT2C/D）时，HBV RNA转录显著下调，上清中分泌的HBV表面抗原（HBsAg）和E抗原（HBeAg）含量显著降低。结果表明，HBV cccDNA可通过宿主甲基转移酶介导病毒的转录调控。该研究拓展了学界关于HBV在人体细胞核中分布特征的认知，为治疗HBV感染及相关疾病提供了新的潜在靶点。
该研究由生物物理所、北京大学和北京协和医院多家单位合作完成，杨鹏远和季雄为论文的共同通讯作者，生物物理所博士生杨博和北大 学院博士生李伯源为论文的共同第一作者。研究工作得到科技部、国家自然科学基金委和中科院的支持。（来源：中国科学院生物物理研究所）
相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41421-020-00218-1
特别声明：本文转载仅仅是出于传播信息的需要，并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性；如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用，须保留本网站注明的“来源”，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，请与我们接洽。
