尽管在20天前，《自然》增刊出版的《2012中国自然出版指数》显示，来自中国的作者2012年度在《自然》和自然子刊上发表的论文数大幅增长，但6月19日同样由《自然》发布的《2012全球自然出版指数》则让我们注意到了另一个细节，即在该出版物涉及的全球200大科研机构的排名中，哈佛大学当选为全球第一的科研机构，其2012年在《自然》系列研究期刊上发表了368篇研究型论文，而这比所有中国科研机构同年在上述期刊上发表的文章数量的总和还要多。
据介绍，自然出版指数 (NPI) 是以国家和机构为单位，根据它们2012年在18本《自然》和自然子刊上发表的研究型科研论文数量进行排名。
在2012年的全球百大科学强国中，美国以2236篇的自然系列期刊论文总数摘得桂冠，这一数字是中国的7倍还要多。英国和德国分别位列第二和第三，日本、法国紧跟其后，中国则位列第六。不过，该杂志还是对中国的科研前景寄予较高期望，鉴于2012年中国作者的研究类论文占《自然》系列研究期刊上所有发表论文的8.5%，《自然》杂志增刊编辑将中国确定为“五大重点关注国家”之一。
此外，入选全球200大科研机构的中国科研机构数量从2011年的3所增至9所。中国科学院在本次2012年的排名中，从2011年排名第22位大幅上升到第12位，跻身全球前20大科研机构。该杂志介绍，在中国所有科研机构中，中科院在
、物理、化学和地球及环境科学这四大学科中，其研究实力都独占鳌头。清华大学在化学领域占据第二的位置，华大基因在
领域被评为中国第二强的机构，而中国科技大学在物理领域的研究实力仅次于中科院。浙江大学在地球及环境科学领域则被列为第二。
放眼全球，同样值得参考的一个数据是，在全球200大科研机构的排名中，美国科研机构占据了前50名中的32个席位。此外，除了排在第一的哈佛大学外，斯坦福大学（Stanford）、麻省理工学院 (MIT)、国立卫生研究院 (NIH)及华盛顿大学等美国科研机构也跻身世界前十大科研机构。
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