本报讯 (记者贺根生)广西科学院研究员杜奇石发现,一种认识尚不充分的作用力——极性氢-p键,在蛋白质无规则廻路结构(loop)中起重要作用。相关成果日前发表于《生物分子结构和动力学》杂志。
据介绍,在蛋白质三维结构中,廻路结构是与a-螺旋、b-折叠并列的二级结构片段,平均有47%的氨基酸残基在loop结构中。1951年,美国化学家鲍林根据氢键的概念,从理论上预测了a-螺旋和b-折叠这两种结构单元的存在,并在6年后被X-衍射实验证实。不过,是什么力量支撑着千姿百态的loop结构?该问题并未从理论上得到合理的解释。
杜奇石发现,在loop结构中存在的极性氢-p键,可能是廻路结构的支撑力。在蛋白质肽链骨架中,当两个肽键单元的p-平面处于同一平面时可形成氢键;而当两个肽键单元的p-平面相互垂直时则可能形成极性氢-p键。高级量子力学扫描计算发现了二肽的四种基本loop构型和其中的四种极性氢-p键类型。由此出发,有可能推导出更复杂的loop结构。
自然界各种生命体的生物功能由蛋白质在执行。蛋白质的一级结构是由几十至数百个氨基酸组成的肽链。肽链经巧妙折叠,构成各种蛋白质独特的三维结构,执行着千差万别的生物功能。肽链的折叠虽复杂却有规律。是什么力量引导肽链的折叠?该问题被称为“蛋白质折叠之谜”。最新研究有助于解开蛋白质折叠之谜,可在蛋白质工程、酶分子理性改造和
其他领域发挥作用。
《中国科学报》 (2015-03-03 第4版 综合)