李虹：以党建促创新，“跨界”的系统生物学家

学术带头人、妇委副主任、党支部书记……中国科学院上海营养与健康研究所（以下简称营养与健康所）研究员李虹身上，有着多个“标签”，正如她的名字一样，如彩虹般多彩。

这些身份汇聚成一起，则是简单的白色。回归人物本身，李虹是一位纯粹、热爱科研的科学家。她被科学的未知所吸引，也为经过努力问题得以解答而欣喜。

获国家自然科学基金优秀青年项目、上海市科技系统“青年五四奖章”荣誉称号、上海市科技系统“三八红旗手”称号、研究成果曾入选中国生物信息学十大应用......李虹却认为自己“只是一名普通的科研工作者”。

李虹。

“跨界”的系统生物学家

作为生物（BT）与信息（IT）融合的科学家，李虹自学生时代以来，经历了几次跨界。

2005年，李虹以年级第一的成绩从中南大学信息与计算科学专业毕业。当同学大多数都去IT或金融行业时，怀着对 好奇心的她，决定去生物学领域看看，来到中国科学院上海 研究院读博，扎进生物信息学领域。

2013年10月，李虹从美国系统生物学研究所再次回到中国科学院上海 研究院，从助理研究员开始，把研究方向从遗传病转向肿瘤，并将系统生物学的思想应用于肿瘤研究。

从数学到生物、从遗传病到肿瘤，回顾这段看似曲折的科研之路，李虹走得不急不躁且坚定。“学数学是偶然，但我非常感谢这段经历。”李虹表示，“本科阶段的基础训练非常有用，有一些知识现在依然可以用到。”

经典 研究大多从假设出发、以实验为主，而生物信息学则是数据密集型的研究。面对假设驱动和数据驱动的鸿沟，首先需要听懂对方的语言。李虹指出：“厘清大数据和生物临床问题之间的逻辑，需要从整体、系统的视角去理解科学问题，再找到最合适的方法解决”。听起来似乎不难，但两者的无缝结合，离不开学科交叉，同时需要生物学家和临床医生之间长期的思想碰撞。

问最重要的问题，啃难啃的“硬骨头”。目前，肿瘤研究是前沿生物技术最为集聚的领域之一，这要求科学家针对新技术持续迭代、优化计算方法。

李虹同合作者在肝癌个体化用药的智能分析和应用、肝损伤再生、胰腺癌肝转移等方向取得系列进展，形成了“科学问题-产生数据-深度分析-实验验证-解决问题”的研究闭环。

“近几年，我们聚焦单细胞和空间多组学数据的共性问题和技术瓶颈，整合分子组学和病理表型，以期通过系统生物学发研究策略，持续优化研究方法，提升解决科学问题的能力。”李虹说道。

同时，李虹结合临床医生的诊断需求，开发病理切片的人工智能模型。“诊断结果直接关系着病人的治疗方案，我们希望通过这个工作，帮助到更多临床医生。”李虹表示，“这是课题组的一个新方向，虽然未必能在短期内看到成果，但非常有必要坚持下去。”

“以党建促创新”

李虹是一名有着二十年党龄的科学家，对她而言，将科研同国家需求相结合，是一件“十分自然”的事情。担任计算生物学第二党支部书记以来，李虹一直在思考，如何将党建工作有效融入科研工作。

近些年，我国肝癌的流行病学发生了显著变化。一方面，在疫苗的普及下，原本主要由乙型肝炎病毒（HBV）感染引起的癌症得到了控制；另一方面，随着人们生活方式的改善，长期的慢性脂肪肝发展为肝癌的患者开始增多。

在“健康中国”的大背景下，是否可以结合系统生物学的方法，在病人的症状发展为癌症之前就开始早期防控，变治“已病”为“未病”？

李虹认为，应该发挥营养与健康所的建制化优势，结合系统生物学的方法，去做一些事情。她主动转变研究方向，带头参与营养与健康所重点部署的“揭榜挂帅”科技任务，同研究所聚焦代谢和免疫的课题组合作。“即便同是湿实验的实验室之间，工作内容也有非常大的差异，因此我们合作前期需要花费相当多的时间和精力，互相沟通学习。”李虹说道。

如今，因为“对共同的科学问题感兴趣”而形成的合作团队，已经形成了“分可独立作战，聚可合力攻关”的氛围，他们协同攻关，共同打造“营养-大数据-健康”为一体的“治未病”平台，探索慢性脂肪肝炎转变为肝癌的机理。

在李虹的带动下，计算生物学第二党支部已成为营养与健康所“以党建促创新”的科研新标杆。2023年，她和其他单位的两位党支部书记共同牵头，联合举办了一个非常有影响力的生物信息学青年论坛。

“我们希望以党建为抓手，把各个单位组织起来，为不同课题组之间提供一个交流平台。”李虹表示，“虽然目前还没有落实到不同支部的科研人员合作申请项目，但是我们相信这是一个很好的开始。”

李虹在学术年会上进行报告分享。图片均由受访者提供

从学生到导师

作为一名由中国科学院培养的“国产”学术带头人，独立成立课题组后，李虹把相当一部分的精力放在了学生培养上。

系统生物学是一个对综合素养要求很高的领域，需要掌握生物学、数学、 等不同领域的知识。李虹课题组的学生也有着不同的背景和兴趣点。她坚持因材施教的原则，和每一位刚入组的学生进行深度沟通，传授入门交叉学科的方法，并帮助他们确定适合自己的课题。

“做第一个课题的过程中，孩子们其实是在学习并了解如何探索未知，过大的不确定性可能会对他们造成很大的打击。”李虹补充，“我不希望我的学生将来带着畏难情绪或者遗憾毕业。”

从第二个课题开始，李虹开始鼓励学生做更有挑战的课题，主导课题的设计，并从中发现新的问题。期间，不乏有学生的选题进展遇到了一定的阻滞，李虹可以感受到他们面临的压力。在协调资源、寻找合作伙伴解决问题的同时，她也会反复去和学生强调课题的重要性，解释进展缓慢的原因。

“我在学生阶段，也在科研中遇到过困难，这是很正常的，我很担心学生会因为课题的不顺利而自我怀疑。”李虹希望用自己的经验教会学生在困难中成长，给他们更多的信心。

在李虹的指导下，近年间实验室陆续有科研成果发表，她为学生开心的同时，更欣慰于他们的成长。李虹也期待着，和学生们一起解决更多难题。