作者:温才妃 来源:中国科学报 发布时间:2022/6/12 12:32:18
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施一公团队构建目前最精确的NPC胞质环结构模型

《科学》以封面专题的形式发表了 5 篇NPC论文,施一公团队的论文是其中一篇。图片来源:science官网

CR亚基的单颗粒冷冻电镜结构  西湖大学供图

大约在12至16亿年前,原始的真核细胞出现。除细菌和蓝藻外,真核生物几乎涵盖了所有动物和植物,当然也包括人类。

在真核细胞的微观世界中,核孔复合物(nuclear pore complex, NPC)是其中最庞大、最复杂的分子机器之一,也是在核膜上负责物质双向运输的唯一通道,其功能异常与包括癌症在内的多种疾病的发生联系在一起。NPC的高分辨率结构解析一直被视为结构生物学界的难解问题之一。

6月10日,西湖大学施一公团队在《科学》上在线发表了题为“非洲爪蟾核孔复合物胞质环的结构”的最新研究成果,报道了目前分辨率最高的NPC中胞质环(CR)亚基的结构。

此前,该团队已成功解析了NPC中核质环(NR)和内环(IR)的高分辨结构,加上此次解析的CR亚基结构,三者共同构成了目前为止最详细且最精确的NPC支架结构模型,为理解脊椎动物NPC的组成、结构、组装以及功能提供了坚实的基础。同时,该模型还提供了多个疾病相关的基因突变在NPC中的位置信息,为疾病诊断以及后续药物开发提供了宝贵的依据。

NPC镶嵌于细胞核的双层核膜(nuclear envelope, NE)之上,在从细胞质到细胞核的方向上,主要由胞质丝(cytoplasmic filaments, CF)、CR、IR、腔环(luminal ring, LR)、NR和核篮(nuclear basket, NB)组成。其中,CR、IR和NR构成NPC最稳定的支架部分,是结构生物学领域关注的重点。

由于NPC分子具有巨大的尺寸和结构柔性,获得完整NPC支架的高分辨率结构具有极高难度。该团队创新性地利用倾转样品台的办法对包埋在核膜中的完整NPC分子进行研究。通过将NPC支架部分拆分成CR、IR和NR三个环状结构,并在各个环内进一步拆分成各个稳定区域,分别进行颗粒对中和三维重构,团队最终获得了迄今为止分辨率最高的核孔复合物CR亚基的冷冻电镜结构,分辨率达3.7-4.7埃。同时,该团队还利用重组表达技术和单颗粒冷冻电镜分析手段,将Nup358的N端结构域解析至3.0埃分辨率。以这些重构结果为基础,该团队最终搭建了迄今为止最完整且最精确的CR结构模型。

该模型中CR亚基的主体由两个Y复合物组成,此外还包含五个Nup358、两个Nup205和两个Nup93分子。在Y复合物中,新解析的Nup160的C端片段作为组织中心,在介导三条臂汇集上起着重要作用。而Nup358、Nup205和Nup93在辅助以及稳定CR骨架的组装过程中起着重要的作用。 据介绍,2020年5月至今,施一公团队先后在Cell Research发表多篇研究论文,报道了非洲爪蟾卵母细胞的 NPC 的腔环(LR)、胞质环(CR)、核质环(NR)、内环(IR)的冷冻电镜结构。他们克服多项技术障碍,从初步确认整体结构再到深入刻画复合物细节,逐步揭开了核孔复合物的神秘面纱。

据悉,西湖大学 学院博士后朱薛辰、黄高兴宇,清华大学 学院2021届博士毕业生(现西湖大学 学院博士后)曾超,西湖大学 学院博士后占谢超和博士生梁珂为论文共同第一作者,黄高兴宇和施一公为该文共同通讯作者。

相关论文信息:https://www.science.org/doi/10.1126/science.abl8280

 

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