《科学进展》

过去190万年非洲南部南极环极流的变化

英国卡迪夫大学研究团队发现，过去190万年里，非洲南部的南极环极流（ACC）发生了变化。相关研究成果近日发表于《科学进展》。

ACC主导着南大洋（SO）周围的热、盐和示踪剂的转移，推动着南极洲周围富含碳的深水的上涌。古气候重建揭示了SO环流的显著变异性，然而，几乎没有记录能将ACC的定量重建与跨越多个更新世冰期循环的SO上升流示踪剂联系起来。

研究人员重建了非洲南部SO的近底部流速变化，揭示了ACC喷流强度和接近度的系统冰期-间冰期变化。这些是由比现在更温暖的“超级间冰期”叠加而成的，其中中纬度ACC（41°S）的极端减速与高纬度ACC（>54°S）的更快流动相反，意味着ACC向极地加强。

结合地下深层稳定碳同位素梯度的重建，研究人员发现，ACC的重组与南极洲周围轻同位素的深水上涌相吻合，这可能是间冰期大气二氧化碳水平升高的原因。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1126/sciadv.adp1692

《物理评论A》

用时钟搜索暗物质

美国特拉华大学的M. H. Zaheer团队与美国国家标准与技术研究院的D. R. Leibrandt等人，提出用时钟搜索暗物质的量子计量算法。相关研究成果近日发表于《物理评论A》。

该团队研究了利用量子钟结合各种量子测量算法搜索暗物质的方法。研究人员提出了一种宽带动态解耦算法，并将其与之前提出并验证过的量子测量协议，即差分光谱学和窄带动态解耦进行了比较。此外，研究人员考虑了实际的噪声源以及暗物质的退相干效应，对标量暗物质的搜索进行了数值模拟。最终他们提出了一种替代性的钍核跃迁激发方法，绕开了与真空紫外激光相关的技术挑战。

诸如动态解耦等量子算法可用于提高量子传感器对信号的灵敏度，同时抑制对噪声的灵敏度。原子钟是最敏感的量子传感器之一，近期技术的进步使得其精度和准确度达到了前所未有的水平。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1103/PhysRevA.111.012601

《自然-遗传学》

单细胞RNA-seq数据揭示肿瘤转录异质性

美国芝加哥大学的Matthew Stephens和北卡罗来纳大学教堂山分校的Yusha Liu团队合作，利用广义二元协方差分解分析单细胞RNA-seq数据，发现了肿瘤转录的异质性。相关研究成果近日发表于《自然-遗传学》。

长期以来，科学家认为利用单细胞RNA测序分析肿瘤有可能发现与癌症进展相关的重复转录变异模式，并为相关治疗提供依据。然而，肿瘤间的强烈异质性可能会掩盖肿瘤间共有的微妙模式。

研究人员引入了一种统计方法——广义二元协方差分解，以解决肿瘤异质性导致的分析难题。研究表明，广义二元协方差分解能将转录异质性分解为可解释的部分，包括患者特异性、数据集特异性和与疾病亚型有关的共有成分，而且在肿瘤间存在巨大异质性的情况下，它能产生比现有方法更具可解释性的结果。

利用广义二元协方差分解分析胰腺导管腺癌数据时，研究人员对现有的肿瘤亚型特征进行细化，发现了一种与肿瘤分期以及亚型无关的不良生存预示基因表达程序。该基因表达程序富含参与应激反应的基因，揭示了综合应激反应在胰腺导管腺癌中的作用。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41588-024-01997-z

《免疫》

慢性病毒感染免疫控制机制获揭示

瑞士巴塞尔大学的Daniel D. Pinschewer团队发现单次消除-腺相关病毒（消除-AAV）载体递送可以持久性消除淋巴细胞亚群，揭示了慢性病毒感染的免疫控制机制。相关研究成果近日在线发表于《免疫》。

研究人员介绍，免疫学家通常使用单克隆消除抗体（消除-mAb）或基因工程小鼠模型（GEMM）研究特定免疫细胞在感染、癌症和自身免疫中的作用。

为了生成一种结合这两种方法特定优点并避免某些缺陷的工具，研究人员设计了消除-AAV。

单次消除-AAV给药可以持久性消除小鼠中的淋巴细胞亚群，并避免GEMM的附加缺陷，如B细胞缺乏动物中的边缘区缺陷。消除-AAV可以在不同遗传背景的动物中使用，且可以轻松组合多种消除-AAV。

利用消除-AAV技术，研究人员展示了B细胞在慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染中，对CD4+T细胞和CD8+T细胞反应的正常发挥至关重要。在B细胞被消除后，CD8+T细胞未能抑制病毒血症，只有在抗体降低病毒载量时，它们才有助于解决慢性感染问题。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.11.021