近日,华南农业大学动物科学学院教授张哲团队携手国内外多个研究团队,借助整合公猪精液品质性状大数据开展全基因组关联分析与多群体荟萃分析,并结合PigGTEx等多组学功能基因组数据,系统解析了公猪精液品质性状的潜在遗传调控机制,同时探究了公猪精液品质性状在人类及奶牛复杂性状中潜在的遗传调控相似性。相关成果发表于《先进科学》。
公猪在繁育体系中占据核心地位,是极为关键的遗传资源。精液品质作为评估公猪种用价值与遗传效率的关键指标之一,对其进行深入的遗传解析意义重大。精准解析精液品质的遗传机制,能够显著加快公猪精液品质性状的分子选育进程,提升选育效率。
在国家重点研发计划等项目资助下,研究团队开展了大规模的数据收集与分析工作。他们收集了四个品种共计14,210头公猪的115万条6个精液品质性状记录,并以此为基础开展全基因组关联分析(GWAS)及荟萃分析。通过严谨的数据分析,研究团队共检测到234个与精液品质相关的基因座,成功解析了公猪精液品质性状的遗传结构。
随后,研究团队进一步整合PigGTEx等多组学功能基因组数据,经过细致筛选,最终确定了93个靶向134个基因的潜在候选基因。例如,NAXE基因通过介导多种组织来调控精子数量性状,而LEFTY2基因仅在睾丸组织中发挥作用调控精液体积性状。此外,全转录组关联分析还发现了TTC29、DMRTA1等关键候选基因。综合各项研究结果,研究团队系统解析了公猪精液品质性状的潜在遗传调控路径。
为进一步拓展研究视野,研究团队结合奶牛重要经济性状、人类复杂性状等数据开展富集分析。结果显示,调控猪与奶牛精液品质性状存在潜在同源基因,如AURKAIP1和ADRA2A基因。此外,研究发现公猪精液品质性状关联信号在人类复杂性状中显著富集。
该研究成果不仅为公猪精液品质性状的选育提供了关键遗传位点和重要候选基因,有望提升选育效率;同时,为跨物种的复杂遗传解析提供了新见解,推动了遗传学领域在跨物种研究方面的发展。
相关论文信息:https://doi.org/10.1002/advs.202515203
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