广东省农业科学院果树研究所研究员陆育生团队与北京大学现代农业研究院研究员郭立团队合作,在黄皮基因组和果实糖酸调控机制研究方面取得新进展。相关成果近日发表于《农业与食品化学杂志》(Journal of Agricultural and Food Chemistry)。
选择印迹分析与全基因关联分析发掘调控黄皮果实糖酸的关键基因。研究团队供图
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论文第一作者、广东省农业科学院果树研究所博士陈慧琼表示,我国是世界黄皮遗传资源最多、栽培面积最广和产量最高的国家。黄皮果实营养丰富,具有抗氧化、防衰老、抑肿瘤等功效,是少有的药食兼用型水果,深受消费者的喜爱。果实风味是决定果树品种的大众接受度的关键因素,而果实糖酸含量是影响果实风味的主要因素。
该研究首先利用三代测序技术和Hi-C组装技术对金丰黄皮基因组进行组装,得到染色体水平的黄皮参考基因组,其大小为284.15 Mb,在Hi-C测序的辅助下,93.83%的组装序列被锚定到9条假染色体上,contig总长297.1 Mb,scaffold总长为297.1 Mb。
接着,研究人员对266份黄皮核心种质进行重测序,通过选择印迹分析与全基因关联分析发掘到调控黄皮果实糖酸的关键转录因子ClERF061和糖转运蛋白基因ClSWEET7,ClERF061和ClSWEET7表达水平和果实糖酸积累显著相关,并初步验证ClERF061具有激活下游靶基因ClSWEET7启动子的功能,推测它们可能共同参与了黄皮果实糖酸积累的调控。
该研究有助于深入了解黄皮果实糖酸品质形成的生理与分子机制,为培育适当糖酸比例、风味好的黄皮品种提供理论依据和基因资源。
相关论文信息:https://doi.org/10.1021/acs.jafc.4c04830
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