“下一代测序技术(NGS)包括全外显子组测序、全转录组测序、全基因组测序以及靶向高通量测序等方法。”全国政协委员、中国工程院院士、上海交通大学转化医学研究院院长陈赛娟对《中国科学报》说,“NGS以通量高、速度快、精度高、成本低等优势在临床疾病分子诊断方面发挥着独特作用。”
陈赛娟举例说,上海交通大学国家转化医学中心(上海)为代表的医疗单位应用NGS技术,发现一批常见癌症和慢性病的新型分子分型标志物和药物靶标,为重大疾病预防、诊断和治疗发挥了至关重要的作用。
血液恶性肿瘤分子分型复杂,应用全转录组测序等方法,可以建立精细分子分型并进行精准治疗,临床上取得了非常好的治疗效果。以急性早幼粒细胞白血病为例,通过疾病精准分型、采取协同靶向致病基因的治疗,“使该病成为第一个可治愈的急性髓系白血病”。
调研中,陈赛娟发现尽管需求巨大,NGS检测在多种恶性肿瘤、复杂慢病和遗传性疾病诊治中必不可少,而且与传统检查方法相比,具有价廉物美、敏感快速和精准分型的优势,但临床应用仍然受到限制。
“相关部门从管理角度出发,认为医疗机构缺乏NSG临床诊断资质许可,而第三方检测机构水平良莠不齐,缺乏统一的质控体系。”陈赛娟说,“因此,建议在国家相关规定下,有步骤试点推进NGS检测在医疗机构的临床应用。”
首先,尽快开展临床实验室自建项目(LDT)。2021年6月1日,《医疗器械监督管理条例》(739号令)正式实施,其中第五十三条规定,对国内尚无同品种产品上市的体外诊断试剂,符合条件的医疗机构根据本单位的临床需要,可以自行研制。
“因此,国家相关职能部门应‘以临床需求为导向’‘以解决临床问题为出发点’,帮助医疗机构解决成果转化‘最后一公里’的问题,指导医疗机构开发NGS检测项目,并应用于临床实践。实现临床应用合规合法,促进领域健康发展。”陈赛娟说。
其次,应制定中国NGS行业规范标准。由于NGS相关技术难度大,人员素质需求强,分析能力要求高。为保证测序结果的可靠、准确、可重复性,建议国家相关部门组织医学专业需求高、NGS设备齐全、相关技术能力强、生物信息学分析水平高的专家制定国家NGS行业相关规范和标准,并建立临检示范基地。
最后,对NGS创新技术要分期分批进行试点放开。
“当前我国已形成覆盖全国的转化医学研究支撑网络。建议国家把有条件的国家级转化中心等作为NGS创新技术先行先试平台,然后在全国范围内分期分批进行试点放开。”陈赛娟补充说,“有条件的国家转化医学中心等,可担负起为NGS基因检测的应用指导和质量评价职责,对相关疾病基因检测的适用范围、检查方法、数据分析、报告解读等进行业务指导,共同推进临床基于NGS的LDT同质化、高水平、高质量发展。”
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